Illumina 시퀀싱 플랫폼에 필요한 기기 세척

07/17/21


여러 가지 요인이 성공적인 시퀀싱 런에 기여합니다. 한 가지 중요한 측면은 시퀀싱 런 사이에 유체 라인이 완전히 세척되어 염 축적을 방지하는 것입니다. 또한 기기가 유휴 상태일 때 유체 시스템을 잘 유지하는 것이 중요합니다.

최신 Illumina 시퀀싱 플랫폼의 도입으로 iSeq 100 및 NextSeq 1000/2000 시스템에는 기기 세척이 필요하지 않습니다. 새 시퀀싱 카트리지에는 펌프, 밸브 및 시스템의 기타 모든 유체가 포함되어 있으며, 이는 런 후 폐기됩니다.

이 게시판은 필요한 세척의 유형, 세척을 완료하는 데 필요한 시간, 모든 Illumina 시퀀싱 기기에 대해 각각의 세척을 얼마나 자주 수행해야 하는지에 대해 설명합니다.

참고: 사용된 물 및 기타 화학물질은 검사실 등급이어야 합니다.

MiSeq | MiniSeq 및 NextSeq 500/550 | HiSeq 1500/2000/2500 | HiSeq 3000/4000/X | cBot 2 | NovaSeq 6000

MiSeq System

세척 유형

설명

준비할 시약

대략적인 시간

빈도

수동 런 후 세척

시퀀싱 런 사이에 표준 기기 세척 수행

0.5% Tween 20 세척 용액

20분

모든 런 후 수행

템플릿 라인 세척을 포함한 수동 런 후 세척

템플릿 라인을 세척하기 위해 사용자가 제공한 NaOCl로 런 후 세척

0.5% Tween 20% 및 0.01% NaOCl 세척 용액

30분

필요에 따라 수행(VeriSeq PGS 런의 경우 런마다 세척이 수행됨)

수동 유지 관리 세척

세척에는 시스템을 철저히 세척하는 일련의 3가지 세척 단계가 포함됩니다.

0.5% Tween 20 세척 용액

90분

30일마다 실시

수동 대기 세척

남은 시약 또는 염 축적을 제거하기 위해 각 위치를 세척하는 2회 연속 세척

0.5% Tween 20 세척 용액

2시간

유휴 모드(≥7일 동안 사용되지 않은 시스템)를 준비하기 위해, 그리고 기기가 유휴 상태인 경우 30일마다 수행합니다.

세척 절차 수행 지침은 MiSeq® System 가이드에서 확인할 수 있습니다.

 

MiniSeq 및 NextSeq 500/550 시스템

세척 유형

설명

준비할 시약

대략적인 시간

빈도

자동 런 후 워시

시퀀싱이 완료되면 소프트웨어는 시약 카트리지에 제공된 세척액과 NaOCl을 사용하여 자동 런 후 세척을 시작합니다.

N/A

60분

모든 런 후 자동

수동 퀵 워시

세척액은 사용자가 제공한 Tween 20 세척액으로 시스템을 세척합니다.

0.05% Tween 20 세척 용액

20분

14일마다 필요(카트리지가 장착된 유휴 기기)

7일마다 요구됨(카트리지가 제거된 건조 상태 또는 NextSeq550용 어레이 모드인 기기)

종료 후 필요

수동 런 후 세척

세척액은 사용자가 제공한 NaOCl 및 Tween 20 세척액으로 시스템을 세척합니다.

0.05% Tween 20% 및 0.12% NaOCl 용액

90분

자동 런 후 세척을 수행하지 않은 경우 필요

세척 절차 수행 지침은 MiniSeq System Guide, NextSeq 500 System Guide 또는 NextSeq 550 System Guide에서 확인할 수 있습니다.

HiSeq 1500/2000/2500 시스템(모든 수동 세척)

세척 유형

설명

준비할 시약

대략적인 시간

빈도

물세척

(SBS 위치 8개)

시스템을 세척하고 유체를 확인하기 위해 각 시퀀싱 런 후 필요

검사실 등급 물

20분

모든 런 후 수행

기기가 1일 이상 유휴 상태인 경우, 새로운 시퀀싱 런을 시작하기 전에 수행

물세척

(SBS 8개 및 페어드 엔드 위치 10개)

시스템을 세척하고 유체를 확인하기 위해 각 시퀀싱 런 후 필요

인덱싱 리드가 포함되거나 페어드 엔드인 시퀀싱 런에 권장

검사실 등급 물

60분

모든 런 후 수행

기기가 1일 이상 유휴 상태인 경우, 새로운 시퀀싱 런을 시작하기 전에 수행

물세척

(SBS 8개, 페어드 엔드 위치 10개 및 템플릿 로딩 위치 1개)

시스템을 세척하고 유체를 점검하기 위해 각 급속 런 모드 시퀀싱 런 후 필요

검사실 등급 물

10분

모든 런 후 수행

기기가 1일 이상 유휴 상태인 경우, 새로운 시퀀싱 런을 시작하기 전에 수행

유지 관리 세척

두 가지 유형의 워크플로우:

(1) Tween 20 및 ProClin 300, 또는

(2) Tween 20만 해당(ProClin 솔루션을 사용할 수 없는 경우)

기기가 5일 이상 유휴 상태인 경우 두 워크플로우 모두 후속 물 세척이 필요합니다.

워크플로우 1

0.5% Tween 20 세척액 및 0.03% ProClin 300 용액

>

워크플로우 2

0.5% Tween 20 세척 용액

130분(고출력 모드의 경우), 60분(빠른 모드의 경우)

런 후 10일마다 선택적으로 수행

유지 관리 세척(고출력에서 Rapid Run 모드로 전환)

Rapid Mode 유지 관리 세척 수행 필요(High Output 모드에서 유지 관리 세척이 이미 수행되었다고 가정)

두 가지 유형의 워크플로우:

(1) Tween 20 및 ProClin 300, 또는 (2) Tween 20만(ProClin 솔루션을 사용할 수 없는 경우)

기기가 5일 이상 유휴 상태인 경우 두 워크플로우 모두 후속 물 세척이 필요합니다.

워크플로우 1

0.5% Tween 20 세척액 및 0.03% ProClin 300 용액

워크플로우 2

0.5% Tween 20 세척 용액

60분

High Output에서 Rapid Run으로 모드를 전환할 때 수행

유지 관리 세척(래피드 런에서 고출력 모드로 전환)

고출력 모드에서 Rapid Mode 유지 관리 세척 후 유지 관리 세척 수행 필요

두 가지 유형의 워크플로우:

(1) Tween 20 및 ProClin 300, 또는

(2) Tween 20만 해당(ProClin 솔루션을 사용할 수 없는 경우)

기기가 5일 이상 유휴 상태인 경우 두 워크플로우 모두 후속 물 세척이 필요합니다.

워크플로우 1

0.5% Tween 20 세척액 및 0.03% ProClin 300 용액

워크플로우 2

0.5% Tween 20 세척 용액

60분 + 130분 = 190분

모드를 Rapid Run에서 High Output으로 전환할 때 수행

세척 절차 수행 지침은 각 시스템 가이드에서 확인할 수 있습니다. HiSeq 1500HiSeq 2000HiSeq 2500.

HiSeq 3000/4000/X 시스템(모든 수동 세척)

세척 유형

설명

준비할 시약

대략적인 시간

빈도

물세척

(SBS 위치 8개)

시스템을 세척하고 유체를 확인하기 위해 각 시퀀싱 런 후 필요

검사실 등급 물

20분

모든 런 후 수행

기기가 1일 이상 유휴 상태인 경우, 새로운 시퀀싱 런을 시작하기 전에 을 수행합니다.

물세척

(SBS 8개 및 페어드 엔드 위치 10개)

시스템을 세척하고 유체를 확인하기 위해 각 시퀀싱 런 후 필요

인덱싱 리드 또는 페어드 엔드가 포함된 시퀀싱 런에 권장

검사실 등급 물

60분

모든 런 후 수행

기기가 1일 이상 유휴 상태인 경우, 새로운 시퀀싱 런을 시작하기 전에 을 수행합니다.

유지 관리 세척

두 가지 유형의 워크플로우:

(1) Tween 20 및 ProClin 300, 또는

(2) Tween 20만 해당(ProClin 솔루션을 사용할 수 없는 경우)

기기가 5일 이상 유휴 상태인 경우 두 워크플로우 모두 후속 물 세척이 필요합니다.

워크플로우 1

0.5% Tween 20 세척액 및 0.03% ProClin 300 용액

워크플로우 2

0.5% Tween 20 세척 용액

90분

런 후 10일마다 선택적으로 수행

세척 절차 수행 지침은 각 시스템 가이드에서 확인할 수 있습니다. HiSeq 3000, HiSeq 4000, HiSeq X.

cBot 2 시스템(모든 수동 세척)

세척 유형

설명

준비할 시약

대략적인 시간

빈도

런 전 및 런 후 물 세척

각 런 전후에 기기 세척을 수행하여 기기 하드웨어에서 염분과 효소를 제거하고 막힘을 방지합니다.

검사실 등급 물

각 런 사이 및 기기가 1일 이상 유휴 상태인 경우

유지 관리 세척

세척을 수행하여 내부 cBot 구성 요소에서 시약 흔적을 제거하고 미생물 성장을 억제합니다.

5% DECON 또는 100 mM NaOH(DECON을 이용할 수 없는 경우)

월 1회 수행

세척 절차 수행 지침은 cBot 2 시스템 가이드 에서 확인할 수 있습니다.

NovaSeq 6000 시스템

세척 유형

설명

준비할 시약

대략적인 시간

빈도

자동 런 후 워시

시퀀싱 런이 완료되면 소프트웨어는 시약 카트리지에 제공된 세척액과 NaOCl을 사용하여 자동 런 후 세척을 시작합니다.

N/A

80분

모든 런 후 자동

수동 유지 관리 세척

세척액은 사용자가 제공한 NaOCl 및 Tween 20 세척액으로 시스템을 세척합니다.

0.05% Tween 20 세척액 및 0.25% NaOCl

80분

런 후 세척으로 4레인 런이 없었거나, 지난 14일 이내에 유지 관리 세척이 수행되지 않았거나, 런 후 세척이 실패하거나 불완전한 경우 이 세척을 수행합니다.

세척 절차 수행 지침은 NovaSeq 6000 시스템 가이드에서 확인할 수 있습니다.