NovaSeq X 시리즈 주문
발전된 화학 반응, 광학, 정보학이 결합되어 뛰어난 시퀀싱 속도와 데이터 품질, 뛰어난 처리량과 확장성을 제공합니다.
Illumina Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion Kit는 대변을 포함한 복잡한 미생물 샘플의 메타트랜스크립톰 시퀀싱을 위한 간소화된 RNA-분석 솔루션입니다.
Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion Kit
메타트랜스크립토믹스 연구를 위한 복잡한 미생물 샘플(예: 대변)에서 바람직하지 않은 숙주 및 전체 박테리아 리보솜 RNA의 빠르고 효율적인 제거.
개요
주요 기능
사양
| 설명 | 이 제품은 복잡한 미생물 샘플에서 풍부한 rRNA 전사물(transcript)을 제거하여 연구자들이 메타트랜스크립톰의 가치가 높고 유익한 부분에 집중할 수 있습니다. 이 키트에는 간소화된 데이터 분석 및 시각화를 위한 BaseSpace Microbiome Metatranscriptomics 앱 액세스 권한이 포함됩니다. |
|---|---|
| 사용량 | 표준 품질 Total RNA 25~1,000 ng |
| 기기 | NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NovaSeq 6000 시스템, MiSeq i100 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템 |
| 작용 기전 | 효소 rRNA 제거, 어댑터 및 인덱스의 라이게이션 기반 첨가 |
| 방법 | 전장 전사체 시퀀싱, 메타전사체 시퀀싱 |
| 핵산 종류 | RNA |
| 특수 샘플의 종류 | 마이크로바이옴 샘플 |
| 종 카테고리 | 마우스, 인간, 래트, 세균 |
| 기술 | 시퀀싱 |
| 변이 클래스 | 새로운 전사물, 전사물 변이 |
애플리케이션
워크플로우 예시
준비
Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion Kit
프로젝트 권장 사항
| 기기 | 권장 샘플 수 | 리드 길이 |
|---|---|---|
| NextSeq 550 시스템 | Mid output: 2 High output: 8 (based on 25-50 million reads per sample) |
2 x 75 bp |
| NovaSeq 6000 시스템 | Whole Transcriptome Analysis: SP: 16 S1: 32 S2: 82 S4: 200 samples per run (based on 25-50 million reads per sample) |
2 × 100 bp |
관련 애플리케이션 및 방법
샷건 메타지노믹스, 16S rRNA 메타지노믹스, 메타트랜스크립토믹스와 같은 NGS 방법을 사용하여 인간 미생물군유전체를 분석합니다.
차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS)이 미생물 유전체학을 변화시키고 있습니다. NGS를 사용하여 새로운 미생물을 발견하고, 질병 발생을 모니터링하고, 먹이 공급원을 분석하는 등의 더 많은 작업을 수행해 보세요.
숙주 및 병원체 유전자 발현을 연구하고 미생물군유전체가 차세대 시퀀싱을 통해 병원체 및 백신에 대한 반응에 어떤 영향을 미치는지 분석합니다.
문서
Support documentation
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비교하기
| Ribo-Zero Plus Microbiome rRNA Depletion Kit | Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus 또는 Ribo-Zero Plus Microbiome | |
|---|---|---|
| 설명 | 이 제품은 복잡한 미생물 샘플에서 풍부한 rRNA 전사물(transcript)을 제거하여 연구자들이 메타트랜스크립톰의 가치가 높고 유익한 부분에 집중할 수 있습니다. 이 키트에는 간소화된 데이터 분석 및 시각화를 위한 BaseSpace Microbiome Metatranscriptomics 앱 액세스 권한이 포함됩니다. | 다양한 RNA-Seq 애플리케이션을 지원하는 저 RNA 입력 및 저품질 샘플에서 전체 전사체 시퀀싱 준비 라이브러리를 준비하는 데 사용됩니다. 풍부한 전사체 분석을 용이하게 하기 위해 여러 종에서 rRNA 및 글로빈 RNA의 단일 튜브 고갈을 위한 Ribo-Zero Plus를 포함한다. |
| 사용량 | 표준 품질 Total RNA 25~1,000 ng | 표준 품질 RNA 검체에 대해 1–1000 ng 총 RNA. 최적의 성능 및 FFPE 검체에 대해 최소 10 ng 총 RNA 권장 |
| 기기 | NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NovaSeq 6000 시스템, MiSeq i100 시스템, MiSeq i100 Plus 시스템 | NextSeq 550 시스템, NextSeq 2000 시스템, NextSeq 1000 시스템, NovaSeq X 시스템, NextSeq 500 시스템, NovaSeq 6000 시스템, NovaSeq X Plus 시스템 |
| 작용 기전 | 효소 rRNA 제거, 어댑터 및 인덱스의 라이게이션 기반 첨가 | 효소 rRNA 제거, 어댑터 및 인덱스의 라이게이션 기반 첨가 |
| 방법 | 전장 전사체 시퀀싱, 메타전사체 시퀀싱 | 전장 전사체 시퀀싱, 메타전사체 시퀀싱 |
| 핵산 종류 | RNA | RNA |
| 특수 샘플의 종류 | 마이크로바이옴 샘플 | 마이크로바이옴 샘플, 사용량이 적은 샘플, FFPE 조직 |
| 종 카테고리 | 마우스, 인간, 래트, 세균 | 마우스, 인간, 래트, 세균 |
| 기술 | 시퀀싱 | 시퀀싱 |
| 변이 클래스 | 새로운 전사물, 전사물 변이 | 단일 염기 다형성(SNP), 유전자 융합, 새로운 전사물, 전사물 변이 |
그림
Ribo-Zero Plus Microbiome Depletion Kit를 사용한 견고한 리보핵산 제거
Ribo-Zero Plus Microbiome Depletion 키트는 단일 튜브 반응에서 인간 및 세균 종에 대한 rRNA(5S, 16S 및 23S) 수준을 효과적으로 제거합니다. 결과는 회사 X의 Ribo-Zero Plus rRNA Depletion Kit 및 시중에서 구할 수 있는 리보핵산제거 키트와 비교합니다. 두 개의 대변 혼합물을 검사했습니다. 샘플 1은 성인과 유아의 대변 샘플이 모두 포함된 혼합물인 반면, 샘플 2는 Zymo(카탈로그 번호 6331)의 시중에서 구할 수 있는 대변 샘플입니다.
리소스
메타트랜스크립토믹스를 이용한 편향되지 않은 미생물 프로파일링
Diversigen and DNA Genotek의 Tonya Ward, Emily Hollister, Le François 박사들이 어떻게 메타트랜스크립토믹 연구를 위한 워크플로우를 개발했는지 알아보고 이 연구 분야의 잠재적으로 영향력 있는 미래에 대한 이들의 견해에 대해 읽어 보세요.
메타트랜스크립토믹스: 도전과 기회
이 웨비나에서는 세 명의 업계 최고 전문가들이 샘플 수집 및 처리, rRNA 제거 및 바이오인포매틱 분석에 대한 인사이트와 주요 고려 사항을 공유합니다.
Illumina® Ribo-Zero Plus rRNA Microbiome depletion kit (96 Samples)
20072062
96개 시료용 Ribo-Zero Plus 키트에 포함된 미생물군 및 표적에서 흔히 발견되는 다양한 박테리아의 리보솜 RNA 고갈을 위한 Ribo-Zero Plus 미생물군유전체 고갈 모듈을 포함합니다. 라이브러리 준비 시약이 포함된 전체 키트의 경우 Ribo-Zero Plus Microbiome 키트가 포함된 Illumina Stranded Total RNA를 주문하십시오.
List Price:
Discounts:
Illumina® Stranded Total RNA Prep with Ligation, Ribo-Zero Plus Microbiome (96 Samples)
20072063
96개 라이브러리를 준비하기 위한 시약 및 Ribo-Zero Plus Microbiome 고갈 모듈이 포함되어 있습니다. Illumina RNA UD 인덱스, 연결용 IDT와만 호환됩니다. 인덱스는 별도로 판매됩니다.
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요약
제품
카탈로그 ID
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단가
-
카탈로그 ID:수량:
MiSeq Reagent Kit v3
클러스터 밀도와 판독 길이를 높여 최적화된 시약 키트로 이전 버전에 비해 시퀀싱 품질 점수가 향상되었습니다.
TruSight Oncology 500
모든 주요 변이 클래스와 FFPE 조직에서 추출한 유전자 시그니처(TMB, MSI 및 HRD)를 다루는 대형 전체 고형암 패널을 통해 CGP를 지원합니다.
Illumina DNA Prep
다양한 시퀀싱 애플리케이션에 사용할 수 있는 빠르고 통합된 라이브러리 준비 워크플로우입니다.
TruSeq RNA Exome
FFPE 조직 및 기타 저품질 샘플의 RNA 시퀀싱을 위한 재현 가능하고 경제적인 솔루션을 제공합니다. 10 ng의 총 RNA로 정확도를 높입니다.
Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus 또는 Ribo-Zero Plus Microbiome
코딩 및 비코딩 전사체 전반에 걸쳐 명확하고 포괄적인 분석을 위한 간소화된 RNA-Seq 솔루션으로 탁월한 연구 유연성을 제공합니다.
Illumina UD Indexes
고유한 듀얼(UD) 인덱스를 사용하면 처리량을 늘리고 비용 절감의 이점을 위해 다중화할 수 있는 고품질 라이브러리를 준비할 수 있습니다.
TruSeq Stranded Total RNA
사람, 쥐, formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) 조직을 포함한 다양한 종(species)과 샘플 유형을 위한 강력하고 확장성이 뛰어난 전장 전사체(transcriptome) 분석(RNA-Seq) 솔루션.
TruSeq Stranded mRNA
mRNA의 시퀀싱 라이브러리를 준비하여 가닥별 정보와 함께 코딩 전사체를 명확하게 볼 수 있습니다.
Illumina Human Comprehensive Panel
Illumina Complete Long Read with Enrichment Library Prep Kit를 사용하여 단백질 코딩 유전자 내에 있는 매핑하기 까다로운 영역에 대해 향상된 커버리지를 제공하기 위해 사전 설계 및 최적화된 패널입니다. 필요한 ≥ 30× 표준 쇼트 리드 전장 유전체와 결합하여 분석됩니다.
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